重庆发布全球首个高糖血橙高质量基因组

　　5月17日，从市农科院传来消息，该院果树所柑橘创新团队发布了国际首个血橙高质量基因组，相关研究成果日前在国际权威期刊《Scientific Data》（中文译名《科学数据》）上发表。

　　血橙属于甜橙类品种，其富含的花青素能够延缓衰老，受到消费者普遍青睐。市特色水果产业技术体系创新团队首席专家孔文斌说，目前国内的血橙主要在川渝地区种植，总的种植面积超过100万亩，其中重庆有40万余亩，“这个体量在我市整个柑橘产业中排名第二，仅次于脐橙，涉及果农10万户左右。”

　　在生产中，现主栽血橙品种多为意大利“塔罗科”品种变异而来的“塔罗科”新系，目前存在品质不稳定等问题。

　　为了改良品种，近年来市农科院果树所柑橘创新团队潜心开展自主品种选育。2019年，他们在育种资源中偶然发现了一株自然变异株，其花青素含量更高，血色更深，糖度也更高。

　　团队随即在该优良变异资源的基础上进行嫁接实验。经过连续4年试验观察，发现其性状稳定、特色鲜明，目前正在申请国家新品种权保护和品种登记，暂命名为“内秀”。

　　“通过实验室检测分析，我们发现‘内秀’确实在甜度和花青素含量等方面都超过了‘塔罗科’新系。但由于这是自然变异而来，我们也在思考这背后到底是什么基因在起作用。”市农科院果树所柑橘创新团队首席专家洪林说。

　　由于国际上尚未有公开发布的高质量的血橙基因组，团队采用目前最先进的三代基因测序技术，启动了“内秀”血橙全基因组测序工作，通过对血橙基因的研究、挖掘、利用，为后续育种提供素材和方向。

　　洪林介绍，此次团队对血橙基因测序深度达到65×，共预测到30395个基因。“65×的深度可以很好地覆盖基因组的完整信息，这意味着我们检测到的基因完整度、精确度更高。目前完整性达到98.2%，可以说是一组高质量的基因组。”

　　据悉，团队现已利用该血橙基因组，与已公布的橙子、柚子、橘子等柑橘基因组进行了比较分析，成功发现了影响血橙花青素合成能力的一些变异基因。

　　洪林表示，未来将通过对血橙基因组信息的深入研究，不断揭开血橙基因的奥秘，发掘更多有用的优异基因资源，为血橙乃至其他作物的生物育种提供帮助。