天津市农业科学院率先揭示番茄叶片早衰调控机制
发布时间:2022-09-09
来源: 天津市农业农村委员会
作者:佚名
近日,《Physiology and Molecular Biology of Plants》在线发表了天津市农业科学院现代都市农业研究所金凤媚研究员为第一作者及通讯作者的“Transcriptome analysis of gene expression in the tomato leaf premature senescence mutant”的研究论文。本研究利用RNA深度测序和生物信息学分析相结合的方法,解析番茄叶片早衰过程中差异表达基因的变化规律,旨在探讨番茄叶片在衰老过程中的生理特性探究可能影响番茄衰老的基因,为番茄衰老分子机制提供理论基础。
本研究在自然突变体中获得了番茄叶片衰老突变体MT318。遗传分析表明,MT318的叶片衰老表型受单隐性核基因控制。首次对野生型和MT318突变体不同阶段生理变化和叶片转录组分析表明,突变体MT318叶片的Fv/Fm、SOD和叶绿素含量逐渐降低,而MDA含量显著增加。GO富集分析表明,生物学过程中的single-organism process、cellular process、metabolic process,分子功能中的binding、catalytic activity细胞组份中的organelle、membrane part参与了叶片的衰老过程。KEGG通路分析表明,“植物激素信号转导”途径在T2阶段最显著富集。Pearson相关分析表明,生长素调控通路和SA信号转导通路可能发挥重要作用。上述结果不仅为MT318早衰基因的进一步克隆和功能分析奠定了基础,也为番茄叶片衰老的研究提供了参考。
原文链接:http://nync.tj.gov.cn/SY0/XWDT152013/XYDT152014/202209/t20220908_5983809.html
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